發(fā)酵雞糞是以健康新鮮的雞糞為原料來生產(chǎn)生物有機(jī)肥。雞糞的加工處理方式多種多樣，有物理方法、 化學(xué)方法、微生物發(fā)酵法、多種方式綜合法，其洋法與土法、古老與現(xiàn)代并存，各有優(yōu)劣，應(yīng)因地制宜。雞糞發(fā)酵作肥料的傳統(tǒng)老辦法是，讓其自然堆積發(fā)酵5~6個月，作飼料也要二十天或一個月左右，這樣臭味散發(fā),既污染環(huán)境又造成養(yǎng)分大量流失。

操作規(guī)程：將發(fā)酵原料按配比準(zhǔn)備1000公斤，此為發(fā)酵原料待用；將雞糞發(fā)酵劑菌種0.5-2.5公斤,納豆菌50-100克倒入350公斤水中稀釋攪拌均勻，稀釋用水好為井水或河水，若為自來水請放置24小時后再用；可以用來養(yǎng)殖魚蝦，不污染水質(zhì)，既可以作為魚蝦飼料，又可以作肥水產(chǎn)品；可以用來養(yǎng)殖黃粉蟲、蠅蛆、蚯蚓建立生態(tài)養(yǎng)殖模式；可以制作種植、花卉等生物有機(jī)肥。

生物有機(jī)肥主要是以微生物生命活動的產(chǎn)物來改善植物的營養(yǎng)條件，抑制某些病菌的繁衍，或以其分泌的物質(zhì)刺激植物生長，發(fā)揮土壤潛在的肥力，提高肥料的利用率，增強(qiáng)植物抗病及抗旱能力，減少環(huán)境污染，提高作物的產(chǎn)量和品質(zhì)。
注意與其他藥、肥分施：生物肥料一般為酸性，并且在其微生物大量繁殖前群體弱小，易被殺傷或殺死，尤其在施用殺菌藥物、化學(xué)肥料時，如同時施入，則兩敗俱傷，在沒有弄清其它藥、肥的性質(zhì)以前，好將生物肥料單施用。注意施用的連續(xù)性：除基肥外，噴施生物肥時，效果在數(shù)日內(nèi)即較明顯，此后能延續(xù)十幾至幾十天.
保存在干凈的空間。據(jù)了解，雞糞有機(jī)肥雖然說一種肥料，但若是在保存過程中接觸到了污染物質(zhì)，或者是一些不利于該種有機(jī)肥存放的化學(xué)成分，或者是其他物質(zhì)等，它們就會出現(xiàn)各種被腐蝕或者是被侵蝕的顯現(xiàn)，如此一來，相應(yīng)的功效，尤其是為農(nóng)作物帶去養(yǎng)分的功效也就會大大的降低了。所以說，保存在干凈的環(huán)境中很有必要。
雞糞發(fā)酵是肥料的一種制作方式，可制作成其他動物的粗飼料，優(yōu)勢是快速啟動發(fā)酵。傳統(tǒng)的發(fā)酵、那么傳統(tǒng)發(fā)酵(露天)達(dá)到腐熟的時間常需1～3個月，其周圍惡臭難聞，蚊、蠅大量滋生，環(huán)境污染十分嚴(yán)重。國內(nèi)外的研究出用發(fā)酵劑快速發(fā)酵表明，向雞糞中添加特定的微生物菌群，能有效促進(jìn)有機(jī)物降解，加速雞糞腐熟速度，同時有利于消除致臭物質(zhì)，減輕對環(huán)境的污染。