枯草芽孢桿菌在代謝過(guò)程中還產(chǎn)生一種具有抑制或殺死它種微生物的枯草桿菌素，從而來(lái)改善水質(zhì)。芽孢桿菌在繁殖過(guò)程中分泌大量的淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶,能迅速降解魚蝦殘留餌料和排泄物，在池內(nèi)其他微生物的共同作用下,大部分進(jìn)一步分解為水和二氧化碳,小部分成為新細(xì)胞合成的物質(zhì),從而凈化水體。

枯草芽孢桿菌在水產(chǎn)養(yǎng)殖中有兩種使用方法，一種是凈水用，另一種是內(nèi)服！
1、凈水用；這是絕大多數(shù)芽孢桿菌的使用情況，也是常見的！枯草芽孢桿菌能大量消耗水體中的有機(jī)質(zhì)，將其分解為小分子有機(jī)酸、氨基酸及氨，改善水質(zhì)，為單胞藻提供營(yíng)養(yǎng)，能夠分解各種有機(jī)質(zhì)，綜合凈化水環(huán)境，改善不良水質(zhì)。
2. 內(nèi)服使用；即添加到飼料中給水產(chǎn)動(dòng)物食用，其實(shí)很多很多內(nèi)服制劑以及飼料中也添加芽孢制劑?？梢愿纳启~蝦蟹的腸胃功能，提高飼料的利潤(rùn)率，改善肉質(zhì)，促進(jìn)長(zhǎng)生，防病效果很好。主要是靠芽孢桿菌的占位效應(yīng)，還有就是能夠產(chǎn)生有益代謝產(chǎn)物。

芽孢桿菌類凈水微生物的使用,使養(yǎng)殖者在不中斷養(yǎng)殖過(guò)程的情況下,清除長(zhǎng)時(shí)間殘留于養(yǎng)殖水域底部廢物,尤其是老蝦池底部積累的大量殘余餌料、排泄廢物、動(dòng)植物殘?bào)w以及有害氣體(氨,硫化氫等),使之先分解為小分子(多肽、脂肪酸等),后分解為更小分子有機(jī)物 (氨基酸、低級(jí)脂肪酸、單糖、環(huán)烴等),終分解為二氧化碳、硝酸鹽、硫酸鹽等,有效降低了水中的COD、BOD,使水體中的氨氮(NH4+-N)與亞硝酸氮(NO2--N)、硫化物濃度降低,從而有效地改善水質(zhì)。同時(shí)還能為以單細(xì)胞藻類為主的浮游植物提供營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),促進(jìn)繁殖。這些浮游植物的光合作用,又為池內(nèi)底棲水產(chǎn)動(dòng)物的呼吸、有機(jī)物的分解提供氧氣,從而形成一個(gè)良性生態(tài)循環(huán)。
芽孢桿菌具有強(qiáng)烈的分解碳系、氮系、磷系、硫系污染物,分解蛋白質(zhì)、復(fù)雜多糖、水溶性有機(jī)物的能力,已被廣泛應(yīng)用。
芽孢桿菌可以凈化養(yǎng)殖水體環(huán)境，芽孢桿菌產(chǎn)生的氯基氧化酶可降低血液及水體中氮氦、亞硝酸鹽、硫化氫的濃度。苷孢桿菌具有很強(qiáng)的蛋白酶、淀粉酶等，可以降解飼料中的某些抗?fàn)I養(yǎng)因子，提高飼料轉(zhuǎn)化率。芽孢桿菌在腸道內(nèi)繁殖，可以產(chǎn)生維生素、氨基酸、未知生長(zhǎng)因子等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，促進(jìn)水產(chǎn)類動(dòng)物生長(zhǎng)。
枯草芽孢桿菌作為水產(chǎn)微生物飼料添加劑的菌株，在生產(chǎn)中的應(yīng)用比光合細(xì)菌、硝化細(xì)菌、乳酸菌等菌株晚。、
隨著近幾年在水產(chǎn)養(yǎng)殖中的應(yīng)用實(shí)踐，枯草芽孢桿菌類微生物飼料添加劑充分顯示出以下幾方面優(yōu)勢(shì)。
枯草芽孢桿菌穩(wěn)定性好、抗性強(qiáng)，具有耐高溫、耐酸堿、耐擠壓等特點(diǎn)。
枯草芽孢桿菌在工業(yè)生產(chǎn)制粒過(guò)程中以及通過(guò)養(yǎng)殖動(dòng)物酸性胃環(huán)境時(shí)均能保持高度穩(wěn)定性。
芽孢一旦形成，便能耐受各種不利條件，如干熱、濕熱、紫外線、射線、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑、真空干燥、氧化作用等。
枯草芽胞桿菌的生物學(xué)性質(zhì)與作用機(jī)理，枯草芽胞桿菌是一種短桿狀、無(wú)莢膜能運(yùn)動(dòng)的革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌，能產(chǎn)生中生芽胞。
枯草芽胞桿菌的分布非常廣泛，土壤、湖泊、海洋、動(dòng)植物體表及其棲息地皆能發(fā)現(xiàn)。枯草芽胞桿菌能產(chǎn)生維生素等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。
枯草芽胞桿菌在生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中能夠產(chǎn)生B1 、B2、 B6等B族維生素和維生素C、維生素K2，為水產(chǎn)動(dòng)物提供維生素營(yíng)養(yǎng)。
枯草芽胞桿菌生命力，代謝旺盛，能在水體中迅速繁殖，并產(chǎn)生大量的胞外酶類，從而大量消耗池塘中的殘餌和動(dòng)物排泄物等大分子有機(jī)質(zhì)。大分子有機(jī)物被分解為小分子的有機(jī)酸、氨基酸等物質(zhì)。能為水體中光合細(xì)菌、藻類以及其他浮游生物提供營(yíng)養(yǎng)，枯草芽胞桿菌使之產(chǎn)生良好的微生態(tài)環(huán)境。并且，芽胞桿菌適合于工業(yè)化大規(guī)模生產(chǎn)，技術(shù)成熟，生產(chǎn)穩(wěn)定．產(chǎn)量高，周期短。尤其是芽胞的休眠體耐酸堿、耐干旱高溫可以長(zhǎng)期貯存。